Le but du traitement médicamenteux est d'obtenir la suppression complète des crises avec le moins d'effets secondaires possibles (idéalement sans aucun effet secondaire), ce qui sera possible dans 70% des cas, mais parfois au prix d'une polythérapie, c'est-à-dire de l'association de plusieurs antiépileptiques. Dans 30% des cas l'épilepsie ne peut être contrôlée complètement par le traitement (elle est dite réfractaire) et le but du traitement médicamenteux devient alors de limiter le nombre et la sévérité des crises.
Pour obtenir un résultat optimal, le choix de la ou des molécules et celui de la dose doivent être judicieusement adaptés au type d'épilepsie et aux particularités du patient (sexe, âge, poids, etc.). Si quelques crises occasionnelles persistent, il suffit parfois de réaménager la dose ou d'associer une deuxième molécule pour obtenir une disparition complète des crises. Un patient ne doit jamais hésiter à revoir son neurologue dans ce but. Idéalement, l'efficacité du traitement doit être telle que le patient retrouve une vie (presque) normale, "comme avant l'épilepsie".
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