Les antidiarrhétiques sont fréquemment prescrits aux patients soufrant de SII. Ils augmentent la durée du transit gastro-intestinal, tout en favorisant l'absorption de l'eau présente dans les aliments. A noter qu'un recours prolongé à un antidiarrhéique ne constitue pas un problème, dès lors que toute cause autre que le SII a été écartée par le médecin. Une diarrhée persistante pouvant être le signe d'une maladie grave, il est nécessaire d'être certain que le responsable est bien le SII.
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