Chaque année, des voyageurs décèdent de la malaria. C'est pourquoi il est important de prendre des médicaments en prophylaxie (prévention). Le choix de ce traitement préventif est du ressort du médecin et dépend des régions visitées, de la saison, de la durée du séjour, des conditions de voyage et du profil personnel.
Les médicaments les plus utilisés en prophylaxie sont la doxycycline et la méfloquine ou une combinaison d'atovaquone et de proguanil. La prise de ces médicaments doit commencer environ une semaine avant le départ (afin de s'assurer que le médicament est bien toléré). Elle doit se poursuivre pendant le voyage et au minimum pendant les deux semaines qui suivent le retour. Au cas où le voyageur s'est fait piquer par un moustique infecté à la fin de son séjour, cette période permet en effet de couvrir le temps d'incubation moyen du parasite.
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